三個月寶寶睡覺揉眼睛搖頭可能是生理因素、缺鈣、過敏、濕疹、毛囊炎等原因所造成，家長需要通過生活干預、日常調理、口服藥物的方法為其改善。

1、生理因素：在成長的過程中可能伴隨著多樣的變化，比如揉眼睛以及搖頭，如果沒有出現(xiàn)異常表現(xiàn)時，一般不用進行特殊治療。

2、缺鈣：經常挑食會導致缺鈣的情況，寶寶容易有神經過于興奮的表現(xiàn)，可能引起上述不適。家長可以讓寶寶攝入含鈣量高的奶粉，添加輔食后，還可以適當讓寶寶吃雞蛋、大豆等食物進行補鈣。

3、過敏：一般是受到過敏原的刺激所造成，會伴隨著皮膚瘙癢、紅腫，容易導致上述情況。家長不宜盲目給寶寶用藥，此時需讓寶寶遠離過敏原，并按時為寶寶清潔皮膚。

4、濕疹：長時間處于陰暗潮濕的環(huán)境中容易引起濕疹，會導致瘙癢的表現(xiàn)，從而引起上述不適。家長需要遵醫(yī)囑使用爐甘石洗劑、復方酮康唑乳膏等藥物為寶寶治療。

5、毛囊炎：如果局部清潔護理不到位的情況下，可能導致毛囊部位出現(xiàn)感染，容易引起多種不適，寶寶可能有上述表現(xiàn)。家長可以在醫(yī)生指導下使用紅霉素軟膏，莫匹羅星軟膏等藥物為寶寶緩解不適。

如果寶寶的不適沒有得到改善，家長應及時帶其就診，必要時遵醫(yī)囑為其治療。